Termin 1 · Cellbiologi · PBL Fall 4

Intracellulär sortering

Proteintransport, organellfunktion och cellulära kvalitetskontroller

01 · Fallet

Patientfallet: Linas utvecklingsförsening

Lina, 18 månader, kommer till barnkliniken med utvecklingsförsening, hepatosplenomegali och neurologisk regression. Det alarmerande är att hon förlorat färdigheter hon redan haft, inte bara halkat efter. Det pekar bort från en ren försening och mot en lysosomal lagringssjukdom. Saknas ett enda nedbrytningsenzym drabbas organ efter organ, och fallet öppnar därmed hela cellens transport- och sorteringsmaskineri.

Kliniska fynd

Utvecklingsförsening
Saknar förväntade motoriska milstolpar
Hepatosplenomegali
Förstorad lever och mjälte av inlagrat material
Neurologisk regression
Förlorat tidigare förvärvade färdigheter
Skelettdeformiteter
Dysostosis multiplex
Återkommande infektioner
Övre luftvägar, sinuit och otit
Grovkorniga drag
Karakteristiska, gradvis förgrovade ansiktsdrag

Status och labb pekar åt samma håll: en cell fylld av material den inte längre kan bryta ner. De fysiska fynden speglar inlagringen i nervsystem, skelett och bindväv. Labbet visar var i kedjan defekten sitter.

Klinisk undersökning

  • Hypotoniminskad muskeltonus
  • Utvecklingsregressiontappat gång och språk
  • Kramperfokala anfall
  • Finmotoriktilltagande svårigheter
  • Tillväxthämningunder 3:e percentilen
  • Dysmorfiska draggrov ansiktsprofil
  • Kyfoskoliosryggradsdeformitet
  • Korneagrumlingögonengagemang

Laboratoriefynd

  • Alfa-L-iduronidaskraftigt nedsatt (<5 % av normalt)
  • Glykosaminoglykanerkraftigt förhöjda i urin
  • Dermatansulfatmarkant förhöjt
  • Heparansulfatpatologiskt förhöjt
  • Fibroblastervakuolisering och inklusioner
  • Lymfocyterazurofila granula (Reilly bodies)
  • Makrofagerskummig cytoplasma
  • Elektronmikroskopizebra bodies, lamellärt material

Differentialdiagnoser

Inlagring, organomegali och neurologisk regression delas av flera lysosomala lagringssjukdomar. De skiljs åt på vilket enzym som fattas och vilket substrat som ansamlas. Enzymanalysen och urin-GAG-mönstret styr diagnosen rätt.

Mukopolysackaridoser (MPS)

  • Hurlers syndrom (MPS I-H)α-L-iduronidas-brist
  • Hunters syndrom (MPS II)iduronat-2-sulfatas-brist, X-bunden
  • Sanfilippo syndrom (MPS III)störd heparansulfat-nedbrytning
  • Morquio syndrom (MPS IV)keratansulfat-ackumulation

Andra lagringssjukdomar

  • Gauchers sjukdomglukocerebrosidas-brist
  • Niemann-Picks sjukdomsfingomyelin-inlagring
  • Tay-Sachs sjukdomhexosaminidas A-brist
  • Krabbes sjukdomgalaktocerebrosidas-brist

Central fråga: hur kan en enda enzymdefekt i lysosomen ge en så bred, systemisk sjukdomsbild? Svaret ligger i hur celler bygger, märker upp och transporterar sina proteiner till rätt plats. Vi följer därför ett protein hela vägen från ribosomen till lysosomen.

02 · Prioritera

Tentafokus

Det här måste du kunna på det här fallet:

  • Organellernas rollerrough/smooth ER, Golgis cis–medial–trans och lysosomens sura miljö
  • Den sekretoriska pathway från SRP/Sec61-insertion via COPII/COPI till Golgi-processing
  • N- vs O-glykosyleringkonsensussekvens, lokalisering och dolichol-prekursorn
  • Den mannos-6-fosfat-pathway som adresserar lysosomala enzymer rätt
  • SNARE- och Rab-proteiner samt motorproteinerna kinesin (plus-änden) och dynein (minus-änden)
  • Hur α-L-iduronidas-brist (Hurlers, MPS I-H) ger GAG-ackumulation och systemisk sjukdom

03 · Organeller

Endoplasmatiskt retikulum

Resan börjar i det endoplasmatiska retikulet, som finns i två varianter med tydlig arbetsdelning. Det grova (rER), klätt i ribosomer, bygger och vecklar proteiner. Det glatta (sER) sköter lipider, hormoner, kalciumlager och avgiftning.

EgenskapRough ER (rER)Smooth ER (sER)
StrukturRibosomer på cytosolsidanInga ribosomer, tubulär
HuvuduppgiftMembran- och sekretoriska proteinerLipidsyntes (fosfolipider, kolesterol)
ModifieringN-glykosylering, signalpeptid-klyvningSteroidhormoner (köns-/stresshormoner)
KvalitetskontrollProteinveckning + ER-stressresponsDetoxifikation via CYP-enzymer
ÖvrigtKotranslationell insertionCa²⁺-lagring (intracellulärt reservoar)
Endomembransystemet, ER, Golgi och vesikeltransport till plasmamembranet · Mariana Ruiz (LadyofHats), Public domain · Wikimedia Commons

Signal Recognition Particle (SRP)

Hur vet ribosomen att just det här proteinet ska in i ER? Svaret är en signalpeptid i proteinets N-terminal som fångas upp av SRP redan medan kedjan byggs:

  1. 1SRP binder signalpeptiden på den nybildade (nascenta) polypeptiden
  2. 2Translationen pausas temporärt så att inget exponeras i förtid
  3. 3SRP guidar hela ribosom–mRNA-komplexet till ER-membranet
  4. 4SRP-receptorn tar emot komplexet och initierar translokationen genom membranet

sER: vävnadsspecificitet

Mängden glatt ER speglar cellens uppgift. Tre exempel:

Hepatocyter

Rikligt sER för detoxifikation (CYP-enzymer) och glukoneogenes

Steroidogena celler

Hög sER-volym för syntes av steroidhormoner (binjurebark, gonader)

Muskelceller

Sarkoplasmatiskt retikulum, specialiserat sER som lagrar och frisätter Ca²⁺

04 · Golgi

Golgi-apparaten & glykosylering

Från ER skickas proteinerna vidare till Golgi, som fungerar som ett löpande band med tre stationer. Cis tar emot vesiklar från ER, medial modifierar sockerkedjorna stegvis, och trans-Golgi-nätverket (TGN) är cellens stora sorteringscentral, där varje protein får sin slutdestination. Det är också här lysosomernas adresslapp läses av.

StationLokalisering & uppgift
Cis-GolgiNärmast ER. Tar emot ER-vesiklar, gör initial N-länkad processing och mannos-trimning.
Medial-GolgiI mitten av stacken. N-länkad glykosylering fortsätter, O-länkad glykosylering inleds och komplexa oligosackarider byggs.
Trans-Golgi (TGN)Längst från ER. Sortering och targeting: M6P-receptorn fångar lysosomala enzymer, sekretoriska och membranbundna proteiner skickas vidare till sin destination.
Golgiapparatens cisterner och vesikeltransport, från cis-Golgi via medial till trans-Golgi-nätverket (TGN) · Kelvinsong, CC BY 3.0 · Wikimedia Commons

N- vs O-länkad glykosylering

Glykosylering, att hänga på sockerkedjor, sker på två sätt. De skiljer sig i var de börjar, vilken aminosyra de fäster på och hur prekursorn ser ut.

EgenskapN-länkadO-länkad
Startar iER-lumen (fortsätter i Golgi)Golgi-apparaten
MålaminosyraAsn (konsensus Asn-X-Ser/Thr)Serin och treonin (Ser/Thr)
PrekursorDolichol-länkad Glc₃Man₉GlcNAc₂GalNAc adderas direkt till Ser/Thr
ProcessEn-bloc-överföring till Asn, sedan stegvis trimningStegvis tillägg, bygger mucintypstrukturer
NoteraOST måste nå sekvensen, den ska vara åtkomligSaknar strikt konsensussekvens

05 · Lysosomen

Lysosomer, autofagi & M6P-pathway

Lysosomen är cellens återvinningscentral och sopförbränning i ett, en sur, enzymfylld blåsa där makromolekyler bryts ner till byggstenar som kan återanvändas. Två egenskaper gör den möjlig: den sura miljön och den stora arsenalen av hydrolaser.

Sur miljö (pH ~4,5–5,0)

V-ATPas-pumpen driver aktiv inpumpning av protoner.

  • Ger optimalt pH för de sura hydrolaserna
  • Fungerar som säkerhetsspärr: enzymerna är inaktiva i den neutrala cytosolen om de skulle läcka ut
  • Bygger protonmotorisk kraft som driver transport över membranet

Hydrolytiska enzymer (~60 olika)

  • Proteasercathepsiner (B, D, L): bryter ner protein
  • NukleaserDNA- och RNA-nedbrytning
  • Lipasert.ex. fosfolipas: bryter ner lipider
  • Glykosidaserα-glukosidas, β-galaktosidas: bryter ner sockerkedjor

Mannos-6-fosfat-pathway

Ett lysosomalt enzym färdas till en början samma väg som alla andra sekretoriska proteiner. Det som styr det rätt är en kemisk adresslapp, mannos-6-fosfat (M6P), som sätts på enzymet och läses av i TGN.

  1. 1Enzymsyntes, de lysosomala enzymerna byggs i rER som vanliga sekretoriska proteiner
  2. 2M6P-märkning, GlcNAc-fosfotransferas adderar adresslappen i cis-Golgi
  3. 3Receptorbindning, M6P-receptorn (MPR) i TGN känner igen och binder lappen
  4. 4Vesikelbildning, enzymet packas i clathrinklädda vesiklar från TGN
  5. 5Lysosomal leverans, vesikeln fuserar med endosom/prelysosom; det sura pH:t släpper enzymet och receptorn recyklas

06 · Sekretion

Sekretoriska pathway

Stegen bildar en sammanhängande resa: insertion i ER, kvalitetskontroll och veckning, och slutligen vesikulär transport vidare. Lysosomala enzymer, sekretoriska proteiner och membranproteiner följer alla samma huvudväg.

1 · ER-insertion (SRP-beroende)

SRP-beroende steg

  • SRP-bindningigenkänning av signalpeptiden
  • Translationspaustemporärt stopp
  • ER-targetinginteraktion med SRP-receptorn
  • Sec61-translokationproteinkanalen öppnas

Sec61-translokonet

  • Proteinledande kanal genom ER-membranet
  • Kotranslationell insertion: proteinet matas in medan det byggs
  • Signalpeptidas klyver av signalpeptiden i lumen
Signalpeptiden avgör destinationen, proteinsortering från ribosomen till ER och vidare i sekretoriska pathway · Neeko Sneako2, CC BY-SA 4.0 · Wikimedia Commons

2 · ER-processering (kvalitetskontroll)

ER släpper bara vidare korrekt veckade proteiner. Chaperoner hjälper veckningen och kvalitetskontrollen fångar upp de felveckade innan de skickas iväg.

Proteinveckning
BiP (GRP78), ER:s centrala chaperon, binder hydrofoba regioner och hjälper proteinet vecka sig rätt
Disulfidbroar
PDI (protein-disulfidisomeras) bildar och korrigerar S-S-bryggor
N-glykosylering
OST-komplexet överför sockerkedjan en-bloc till Asn
ERAD
ER-associerad degradation, felveckade proteiner skickas till proteasomen för nedbrytning

3 · Vesikulär transport

Mellan ER och Golgi pendlar två sorters vesiklar i motsatt riktning. Coat-proteinet avgör vart de far.

ER → Golgi och tillbaka

  • COPII-vesiklaranterograd transport, ER → Golgi
  • ERGICmellanstation mellan ER och Golgi
  • COPI-vesiklarretrograd transport, hämtar tillbaka ER-proteiner

Golgi-processing

  • Successiv modifiering medan proteinet rör sig genom stacken
  • Beskrivs av cisterne-maturations- respektive vesikeltransport-modellen

07 · Upptag

Endocytiska pathway

Cellen tar också in material, och även den vägen är receptorstyrd och vesikelburen. Mest selektiv är clathrinmedierad endocytos, som plockar upp specifika ligander via sina receptorer.

Receptormedierad (clathrin) endocytos

  1. 1Ligandbindning, specifik receptor–ligand-interaktion vid cellytan
  2. 2Clathrinhölje byggs, AP2-adaptiner rekryterar clathrin till membranet
  3. 3Invagination, membranet böjs inåt och bildar en grop
  4. 4Dynaminmedierad avsnörning, vesikeln knips av från membranet
  5. 5Avhöljning, auxilin och HSP70 tar bort clathrinhöljet så vesikeln kan fusera vidare

Clathrin

Coat-protein som formar det krökta vesikelhöljet (triskelion-struktur)

Adaptiner (AP2)

Länkar clathrin till membranet och väljer ut cargo

Dynamin

GTPas som ringlar runt vesikelhalsen och snör av den

Övriga upptagsvägar

Bulkendocytos

  • Pinocytos"cell drinking": konstant upptag av vätska
  • Makropinocytosstora volymer, drivs ofta av tillväxtfaktorer
  • Fagocytosstora partiklar och bakterier (makrofager, neutrofiler)

Caveolaemedierad endocytos

  • Caveolin-1-märkta inbuktningar i membranet
  • Kolesterolrik miljö (lipid rafts)
  • Fungerar även som signaleringsplattform

08 · Vesikeltrafik

SNARE- & Rab-proteiner

Varje vesikel måste hitta rätt målmembran och smälta samman med det. Två proteinfamiljer delar på jobbet: SNARE svetsar ihop membranen, medan Rab-GTPaser ger adressen och avgör vart vesikeln ska. v-SNARE och t-SNARE skiljs åt av vilket membran de sitter på.

Egenskapv-SNARE (vesikel)t-SNARE (target)
Sitter påTransportvesikelnMålmembranet
FunktionVesikelns fusionspartnerMålmembranets fusionspartner
ExempelVAMP/synaptobrevinSyntaxin + SNAP-25

Fusionsprocessen

  1. 1SNARE-parning, v-SNARE på vesikeln möter t-SNARE på målmembranet
  2. 2Trans-SNARE-komplex, proteinerna tvinnas till en stram helixbunt
  3. 3Membranen dras ihop, komplexet drar de två membranen mot varandra
  4. 4Membranfusion, lipidlagren smälter samman och porten öppnas
  5. 5Cis-SNARE-komplex, efter fusionen sitter alla SNARE i samma membran
  6. 6NSF/α-SNAP-demontering, komplexet plockas isär med ATP så proteinerna kan återanvändas

Rab-GTPaser: kompartmentadresser

Människan har runt 70 olika Rab-proteiner, förankrade i membranen via geranylgeranyl-svansar. De växlar mellan ett aktivt GTP-bundet och ett inaktivt GDP-bundet tillstånd, och ger på så vis varje kompartment sin egen molekylära adress.

RabLokaliseringFunktion
Rab5Tidiga endosomerFusion av inkommande clathrinvesiklar
Rab7Sena endosomer / lysosomerMognad och endosom–lysosom-fusion
Rab11RecyklingsendosomerÅterföring av receptorer till cellytan
Rab27Sekretoriska vesiklarExocytos / frisättning

09 · Cytoskelett

Mikrotubuli & motorproteiner

Vesiklar driver inte fritt genom cytoplasman. De fraktas aktivt längs mikrotubuli av motorproteiner som vandrar i bestämda riktningar. Två motorer drar last åt motsatta håll, och riktningen är det centrala att hålla isär.

EgenskapKinesinCytoplasmatiskt dynein
RiktningMot plus-änden (cellperiferin)Mot minus-änden (cellcentrum)
FunktionAnterograd axonal transportRetrograd transport
Bärs avMotordomän + coiled-coil + cargo-domänTunga kedjor (motor) + dynactin + adaptorer

Viktiga kinesintyper

Kinesin-1 (KIF5)

Den konventionella kinesinet, generell anterograd vesikeltransport

Kinesin-3 (KIF1)

Snabb axonal transport av t.ex. synaptiska vesikelprekursorer

Kinesin-13

Vandrar inte, depolymeriserar i stället mikrotubuli vid ändarna

Många organeller bär både kinesin och dynein samtidigt. Vilken riktning lasten rör sig avgörs av balansen mellan motorerna, där lokala signaler och cargospecifika adaptrar bestämmer vem som drar starkast just då.

10 · Fallets molekyl

Hurlers syndrom (MPS I-H)

Hurlers syndrom är den svåraste formen av mukopolysackaridos typ I och beror på brist på ett enda lysosomalt enzym. Eftersom det enzymet behövs i nästan alla vävnader blir konsekvenserna systemiska.

Molekylär grund

Enzymdefekt
Brist på α-L-iduronidas (genen IDUA)
Genetik
Autosomalt recessiv, genen ligger på kromosom 4 (4p16.3)
Prevalens
Cirka 1 på 100 000 födslar
Substrat som ansamlas
Dermatansulfat (bindväv, hjärtklaffar) och heparansulfat (bl.a. CNS) → progressiv lysosomal inlagring

Inlagringen börjar i cellen och når sedan vävnadsnivå. Lysosomerna sväller och stör flera processer, och kliniskt slår det mot de organ som är rikast på de inlagrade GAG-erna.

Cellulär dysfunktion

  • Lysosomal expansionblåsorna sväller av inlagrade GAG
  • Störd autofagiblockerat autofagiskt flöde
  • Mitokondriell dysfunktionsekundärt energiunderskott
  • ER-stressunfolded protein response aktiveras

Vävnadseffekter

  • Skelettdysostosis multiplex, växthämning
  • CNSneurodegeneration, utvecklingsförsening
  • Hjärta/kärlklaffsjukdom och kardiomyopati
  • Ögonkorneagrumling, retinal degeneration

11 · Substrat

Glykosaminoglykan-metabolism

Linas symtom följer av substraten som inte bryts ner. Glykosaminoglykaner (GAG) är långa, sulfaterade sockerkedjor som ger bindväv struktur och binder tillväxtfaktorer. De två som ackumuleras i Hurlers, dermatan- och heparansulfat, förklarar varför sjukdomen drabbar skelett, hjärtklaffar och nervsystem.

GAGLokaliseringFunktion
DermatansulfatHud, bindväv, hjärtklaffarStrukturellt stöd och cellulär signalering
HeparansulfatBasalmembran, cellyta, CNSBinder tillväxtfaktorer, cellulär signalering

GAG-nedbrytningsväg

Nedbrytningen sker stegvis i lysosomen, där en kedja av enzymer klyver bort en sockerenhet i taget. Stegen måste ske i ordning: saknas ett enzym kan inget enzym längre fram komma åt sitt substrat.

  1. 1Endocytos, GAG-rika proteoglykaner tas upp i cellen
  2. 2Lysosomal nedbrytning, kedjan kortas stegvis, en enhet i taget
  3. 3α-L-iduronidas-steget, enzymet klyver iduronsyrabindningar
  4. 4Vidare nedbrytning, efterföljande lysosomala enzymer tar vid
  5. 5Återvinning, enkla sockerarter och sulfat frigörs och återanvänds

α-L-iduronidas ligger mitt i kedjan. Saknas det stannar nedbrytningen där, och substratet ansamlas progressivt i lysosomen. En enda enzymbrist räcker alltså för att blockera nedbrytningen helt.

12 · Handläggning

Klinisk handläggning

Hur ställs diagnosen, och vad kan vi erbjuda Lina? Utredningen går från klinisk misstanke till säkerställd enzym- och gendefekt. Behandlingen syftar till att ersätta det som fattas.

Diagnostik (stegvis)

  1. 1Klinisk misstanke, den karakteristiska fenotypen väcker frågan
  2. 2GAG-screening, kvantifiering av glykosaminoglykaner i urin
  3. 3Enzymanalys, mätning av α-L-iduronidas-aktivitet (bekräftar diagnosen)
  4. 4Molekylär genetik, IDUA-genanalys identifierar mutationen
  5. 5Bilddiagnostik, skelettöversikt och MR hjärna kartlägger organengagemang

Behandling

Enzymersättningsterapi (ERT)

Läkemedel: laronidas (rekombinant α-L-iduronidas)

Administration: intravenös infusion en gång per vecka

  • Minskar lever- och mjältstorlek
  • Sänker GAG-nivåerna i kroppen
  • Når dock inte CNS: passerar inte blod–hjärnbarriären

Hematopoetisk stamcellstransplantation

Timing: bör ske tidigt i förloppet, helst före 2 års ålder

  • Donatorceller ger enzym som även kan nå CNS
  • Långsiktig, endogen enzymproduktion
  • Möjlighet att bromsa den neurologiska utvecklingen

Risk: betydande transplantationsrelaterad mortalitet

13 · Slutsats

Från molekyl till fenotyp

Linas sjukdom visar hur en enda enzymdefekt, via störd intracellulär sortering och nedbrytning, ger en systemisk sjukdomsbild. Kedjan löper i tre led, där varje led följer på det föregående.

  1. 1Enzymdefekt → substratansamling, α-L-iduronidas-brist gör att GAG ansamlas i lysosomerna
  2. 2Cellulär dysfunktion, inlagringen stör autofagi, energimetabolism och cellens normala funktion
  3. 3Systemiska effekter, yttrar sig som utvecklingsförsening, organomegali och skelettdeformiteter

Terapeutiska ansatser

Varje led i kedjan ger en angreppspunkt, och så tänker man kring behandling av lysosomala lagringssjukdomar i stort.

Enzymersättning
Tillför det enzym som saknas (ERT)
Substratreduktion
Minskar produktionen av det material som ansamlas
Cellterapi
Transplanterar friska celler som producerar enzymet
Genterapi
Korrigerar den underliggande genetiska defekten

14 · Resurser

Videor & länkar

Membranstruktur och transport: grundläggande membranbiologi och transportmekanismer som ligger bakom Linas lysosomala dysfunktion.